肺部良性肿瘤通常不会恶变，但极少数情况下可能因长期刺激或特殊病理类型发生恶变。肺部良性肿瘤多为错构瘤、炎性假瘤等，生长缓慢且边界清晰。
肺部良性肿瘤的细胞分化良好，生长方式多为膨胀性而非浸润性，与周围组织分界清楚。这类肿瘤通常通过影像学检查即可初步判断性质，例如胸部CT显示光滑边缘、钙化灶等特征。临床常见的肺错构瘤由正常组织异常排列构成，脂肪和软骨成分在影像中呈现典型特征，这类肿瘤恶变概率极低。炎性假瘤多为肺部感染后遗留的肉芽肿性病变，通过抗炎治疗甚至可能缩小。
少数情况下，长期存在的良性肿瘤若受到持续物理或化学刺激，可能发生基因突变。例如支气管内乳头状瘤若合并HPV感染，反复炎症可能导致细胞异型增生。某些病理类型如肺硬化性肺泡细胞瘤虽归类为良性，但存在局部侵袭性生长的报道。若初次活检取样误差将恶性肿瘤误判为良性，也可能被误认为良性肿瘤恶变。
建议确诊肺部良性肿瘤后定期随访，每6-12个月复查低剂量胸部CT观察变化。避免吸烟、接触石棉等致癌物，减少呼吸道刺激。若出现咳嗽加重、痰中带血等异常症状应及时就诊，必要时通过穿刺活检或手术切除明确病理诊断。日常保持适度运动增强肺功能，注意预防呼吸道感染。