肛裂手术的疼痛程度因人而异，多数患者在麻醉作用下术中无明显痛感，术后1-3天可能出现可控的伤口疼痛。
现代肛裂手术通常采用局部麻醉或骶管麻醉，术中患者保持清醒但不会感到疼痛。术后麻醉消退后，伤口可能出现钝痛或灼痛感，疼痛评分多在3-5分范围内，可通过口服对乙酰氨基酚片、双氯芬酸钠栓等镇痛药物缓解。部分患者术后排便时可能出现短暂刺痛，保持大便软化能显著减轻不适。术后换药时医生会使用利多卡因凝胶等表面麻醉剂，多数患者反馈换药疼痛在可耐受范围内。术后2周左右随着创面愈合，疼痛感会逐渐消失。
术后建议保持每日2000毫升饮水量，增加芹菜、火龙果等富含膳食纤维的食物摄入，避免久坐久站，便后使用1：5000高锰酸钾溶液坐浴10分钟。术后1个月内禁止剧烈运动和重体力劳动，遵医嘱定期复查伤口愈合情况。若出现持续剧烈疼痛、发热或大量出血需立即就医。