月经后第三天同房怀孕概率较低，但并非完全不可能。怀孕概率与排卵时间、月经周期规律性等因素密切相关。
女性月经周期通常为28天左右，排卵多发生在下次月经前14天。若月经周期规律且为28天，月经后第三天处于卵泡期早期，此时卵泡尚未成熟，同房后精子在女性生殖道内可存活1-3天，但通常难以等到排卵发生。月经周期短于25天的女性，排卵可能提前至月经后7-10天，此时同房精子存活时间可能与排卵期重叠，存在受孕可能。月经周期不规律的女性排卵时间难以预测，任何无保护性行为均存在意外怀孕风险。
少数情况下，女性可能因激素波动出现额外排卵，或在月经未完全结束时提前排卵。部分女性月经期较长，月经后第三天实际已接近排卵期。这些特殊情况均可能导致月经后三天同房受孕。紧急避孕药仅对排卵前72小时内的无保护性行为有效，若已发生排卵则无法阻止受孕。
建议月经周期不规律或存在生育需求的女性通过基础体温测量、排卵试纸等方式监测排卵期。若无生育计划，任何时期同房均应采取避孕套等可靠避孕措施。短效口服避孕药需严格遵医嘱规范服用才能达到理想避孕效果。若月经延迟超过7天或出现早孕反应，应及时进行早孕检测。保持规律作息、均衡饮食有助于维持月经周期稳定，避免过度节食或剧烈运动导致内分泌紊乱。