月经第三天同房怀孕概率极低，但并非完全不可能。怀孕需要排卵期前后同房，月经第三天通常不属于排卵期，但若月经周期过短或排卵异常，仍存在理论上的受孕可能。
女性排卵通常发生在下次月经前14天左右，月经周期为28天者排卵日在第14天，此时卵子排出后存活12-24小时，而精子在女性生殖道可存活2-3天。月经第三天子宫内膜刚脱落，卵泡尚未发育成熟，且宫颈黏液稠厚不利于精子穿透，这些因素均会大幅降低受孕概率。正常月经持续3-7天，月经结束后5-7天才逐步进入排卵期，此时同房受孕概率较高。
少数月经周期短于21天者，可能在月经结束1-2天内排卵。部分女性存在排卵提前或月经期排卵的异常情况，可能与内分泌紊乱、多囊卵巢综合征等疾病相关。紧急避孕药、精神压力等因素也可能导致排卵时间改变。若月经第三天同房后出现停经、恶心等早孕症状，建议进行早孕检测。
若无备孕计划，建议全程使用避孕套等避孕措施。月经期同房可能增加生殖道感染风险，应避免此类行为。若月经周期长期紊乱或存在异常出血，需及时就医排查妇科内分泌疾病。