甲状腺乳头状癌存在复发可能，但概率相对较低。复发风险与肿瘤分期、手术彻底性、术后管理等因素相关。
甲状腺乳头状癌复发多与初次手术时肿瘤残留有关。若肿瘤侵犯周围组织或存在淋巴结转移，术后未规范进行放射性碘治疗或甲状腺激素抑制治疗，可能增加局部复发风险。部分患者因基因突变导致肿瘤侵袭性较强，即使早期手术也可能出现远期转移。
少数情况下，患者术后未定期监测甲状腺功能及甲状腺球蛋白水平，可能延误复发诊断。极少数患者因存在隐匿性转移灶或对放射性碘治疗不敏感，可能在治疗后数年出现肺、骨等远处转移。
术后应严格遵医嘱定期复查甲状腺功能、颈部超声及甲状腺球蛋白检测，保持促甲状腺激素在目标范围内。日常注意均衡饮食，适量摄入海产品补充碘元素，避免过度劳累和精神压力。若发现颈部肿块、声音嘶哑或骨痛等症状需及时就诊。