吃生大蒜可能会拉肚子，也可能不会拉肚子。生大蒜含有大蒜素等刺激性成分，可能刺激胃肠黏膜，导致腹泻。胃肠功能较弱或存在胃肠疾病的人群更容易出现拉肚子的情况。
生大蒜中的大蒜素具有强烈的刺激性，可能直接作用于胃肠黏膜，引起胃肠蠕动加快，导致腹泻。大蒜素还可能刺激胃酸分泌过多，加重胃肠负担。胃肠功能正常的人群少量食用生大蒜通常不会引起明显不适，但过量食用仍可能引发腹泻。
存在慢性胃炎、胃溃疡、肠易激综合征等胃肠疾病的人群，胃肠黏膜较为敏感，食用生大蒜后更容易出现腹痛、腹泻等症状。生大蒜还可能改变肠道菌群平衡，导致肠道功能紊乱。对大蒜过敏的人群食用后可能出现过敏性胃肠炎，表现为腹泻、呕吐等症状。
建议胃肠功能较弱的人群避免空腹食用生大蒜，可将大蒜煮熟后食用以减少刺激性。食用生大蒜后出现持续腹泻、腹痛等症状时，应及时就医检查。日常饮食中应注意观察自身对大蒜的反应，适量食用。保持饮食均衡，避免过度依赖单一食物。出现胃肠不适时可暂时选择清淡易消化的食物，必要时在医生指导下使用药物治疗。