新生儿做CT检查的辐射剂量通常控制在安全范围内，短期单次检查一般不会造成明显影响，但需严格遵循临床必要性原则。
CT检查对新生儿的潜在影响主要与辐射暴露相关。婴幼儿组织器官对辐射敏感性较高，但现代低剂量CT技术已大幅降低辐射量。头部CT的有效辐射剂量约为2-4毫西弗，相当于自然环境中6-12个月的背景辐射量。检查过程中医务人员会采用铅防护毯遮盖非检查部位，进一步减少散射辐射。医疗级CT设备的辐射输出均符合国际安全标准，单次检查的致癌风险概率低于万分之一。
需警惕特殊情况下的风险累积。早产儿或需多次复查的危重患儿可能接受超过3次CT检查，累积剂量可能达到10毫西弗以上。极低出生体重儿接受腹部CT时，性腺等敏感器官可能受到较高剂量辐射。部分先天性心脏病患儿需进行心电门控CT，扫描时间延长可能增加辐射暴露。这些情况下建议优先考虑超声或MRI等无辐射检查方案。
新生儿接受CT检查后，家长应密切观察有无喂养困难、异常哭闹或皮肤红斑等反应，保持检查部位清洁干燥。哺乳期母亲无须中断喂养，但可适当增加富含维生素C和番茄红素的蔬果摄入。日常护理中注意避免反复进行非必要的影像学检查，定期儿童保健随访时主动向医生告知既往CT检查史，必要时可通过放射防护机构评估累积辐射剂量。