先天性心脏病的手术时机需根据具体类型和病情决定，多数患儿在1岁内需接受手术干预，部分复杂病例可能需分期手术或新生儿期紧急处理。
对于室间隔缺损、房间隔缺损等简单先心病，若缺损较小且无症状，可随访观察至3-6岁再评估手术必要性。若存在反复肺炎、生长发育迟缓或肺动脉高压趋势，建议在6个月-2岁期间完成手术。法洛四联症等紫绀型先心病通常需在3-12月龄实施根治术，当出现缺氧发作时需提前手术。完全性大动脉转位等危重畸形，应在出生后2周内行动脉调转术。左心发育不良综合征等复杂畸形需在新生儿期开始分阶段手术。
极少数轻症病例如小型动脉导管未闭可能无须手术，通过介入封堵即可解决。部分合并严重肺部感染或心力衰竭的患儿需先稳定病情再手术。早产儿或低体重儿可能需延迟手术至体重达标。某些特殊类型如Ebstein畸形的手术时机需个体化评估。
术后需定期复查心脏超声和心电图，避免剧烈运动6个月以上，按医嘱服用抗凝药物如华法林钠片，预防呼吸道感染，保证高蛋白饮食但控制液体摄入量。家长应学会监测心率、唇色和尿量变化，疫苗接种需咨询心外科医生，术后1年内每3个月随访1次。注意观察有无活动后气促、下肢水肿等心功能异常表现，学龄期儿童返校前需进行运动风险评估。