脚气和灰指甲通常由不同种类的真菌引起，但可能存在交叉感染。脚气多由红色毛癣菌等皮肤癣菌引起，灰指甲则主要由须癣毛癣菌等甲真菌感染所致。
脚气在医学上称为足癣，致病菌以红色毛癣菌、絮状表皮癣菌为主，这些真菌喜好潮湿环境，常通过接触传播。典型症状包括趾间糜烂、足底脱屑伴瘙痒，夏季易加重。治疗需保持足部干燥，可遵医嘱使用联苯苄唑乳膏、硝酸咪康唑散等抗真菌药物。
灰指甲即甲真菌病，致病菌中须癣毛癣菌占比最高，其次为白色念珠菌。真菌通过破损甲板侵入，导致甲板增厚、变色或分离。由于指甲结构致密，治疗周期较长，可能需要口服特比萘芬片配合环吡酮胺搽剂等外用药。两种疾病虽病原体不同，但若足癣未及时治疗，真菌可能蔓延至甲床引发继发性灰指甲。
预防脚气和灰指甲需注意避免共用鞋袜、修甲工具等物品，每日更换透气棉袜并用60℃以上热水洗涤。公共场所尽量不赤足行走，沐浴后及时擦干趾缝。若已出现症状，应避免抓挠防止自身接种感染，同时遵医嘱完成全程治疗以防复发。糖尿病患者等免疫力低下人群更需警惕混合感染风险。