痔疮手术可能伴随术后疼痛、创面感染、肛门狭窄、复发风险及暂时性排便障碍等缺点，具体风险与手术方式及个体差异相关。
痔疮手术后的疼痛感较为常见，尤其在外剥内扎术等传统术式中更为明显，疼痛可能持续数日至一周，影响日常活动与睡眠质量。创面感染多因术后护理不当或免疫力低下导致，表现为局部红肿、渗液或发热，需及时抗感染处理。肛门狭窄是吻合器痔上黏膜环切术等术式的潜在并发症，与瘢痕过度增生有关，可能需二次手术松解。复发风险与饮食习惯、排便习惯未改善相关，即使手术切除病灶，若诱因持续存在仍可能再发。部分患者术后短期内可能出现排便困难或失禁，与肛门括约肌暂时性功能紊乱相关，多数可随康复训练逐步恢复。
微创手术如激光或超声刀治疗可减少组织损伤，降低传统术式的部分风险，但对严重脱垂性痔疮效果有限。高龄、糖尿病或凝血功能障碍患者术后并发症概率相对较高，需加强围手术期管理。术中神经损伤可能导致肛门感觉异常，但发生率较低。少数患者对麻醉药物敏感，可能引发恶心、头晕等不良反应。术后需严格遵循医嘱进行坐浴、用药及复诊，以最大限度规避上述风险。
术后应保持高纤维饮食，每日饮水超过2000毫升，避免辛辣刺激食物，预防便秘加重创面负担。规律进行提肛运动有助于恢复肛门肌群功能，术后2周内避免久坐久站，可使用环形坐垫分散压力。便后需用温水清洁肛门，遵医嘱使用复方角菜酸酯乳膏等外用药物促进愈合。术后1个月内禁止剧烈运动或重体力劳动，定期复查评估恢复情况，若出现异常出血、持续发热需立即就医。建立定时排便习惯，每次如厕时间控制在5分钟内，减少腹腔压力对手术部位的刺激。