适量服用叶酸通常无明显副作用，但长期过量服用可能引起恶心、腹胀、食欲减退等不适，部分人群可能出现过敏反应。
叶酸作为水溶性维生素，常规剂量下多余成分可随尿液排出，安全性较高。每日补充量不超过1毫克时，多数人仅可能出现轻微胃肠刺激症状，如饭后服用可减轻不适。对合成叶酸敏感者可能出现皮肤瘙痒或红疹，此时需停用并就医。长期每日摄入超过1毫克可能掩盖维生素B12缺乏的贫血症状，干扰锌元素吸收。备孕及妊娠期女性应按医嘱控制剂量，避免影响胎儿发育。
建议通过动物肝脏、深绿色蔬菜等天然食物获取叶酸，需补充制剂时应选择正规药品而非保健品，服药期间观察排便颜色及皮肤反应，避免与抗惊厥药、磺胺类药物同服，慢性肾病患者补充前需评估肾功能，出现持续头痛或口唇麻木需及时就诊。