头发种植手术过程中通常不会感到明显疼痛，术前会进行局部麻醉以减轻不适感。
头发种植手术采用局部麻醉技术，麻醉生效后操作区域会暂时失去痛觉，术中仅能感知轻微牵拉感。现代植发技术如FUE毛囊单位提取术通过精密器械提取毛囊，创口直径小于1毫米，术后疼痛感较轻。部分患者可能在麻醉消退后出现短暂胀痛，程度多与日常头皮磕碰相近，2-3天内逐渐缓解。医生会根据个体情况开具止痛药物，但多数人无须使用即可耐受。
极少数对疼痛特别敏感者，或既往有慢性疼痛病史的患者，可能出现较明显的不适感。这类情况需提前告知医生，可通过调整麻醉方案或使用镇痛泵等方式改善体验。术后若出现持续剧烈疼痛、跳痛等异常表现，可能提示感染或出血等并发症，需立即联系医生处理。
术后应保持种植区域清洁干燥，避免抓挠或摩擦头皮，睡眠时垫高头部有助于减轻肿胀。饮食上多补充优质蛋白和维生素C，促进毛囊修复，暂时避免辛辣刺激食物。恢复期内减少剧烈运动，防止汗液刺激创面，按医嘱使用抗菌喷雾护理。新移植的毛发会在2-3周后进入脱落期，属于正常现象，3-6个月后新生发会逐渐长出。定期复诊让医生评估毛囊存活情况，发现问题及时干预。