种植头发时通常会有轻微疼痛感，但多数情况下可以耐受。手术过程中会使用局部麻醉药物减轻不适，术后可能出现短暂胀痛或头皮紧绷感。
毛发移植手术前医生会在头皮注射局部麻醉药如利多卡因，注射时会有短暂刺痛感，麻醉生效后手术区域会失去痛觉。术中患者可能感受到器械操作的压力或牵拉感，但不会出现剧烈疼痛。术后麻醉消退后部分人会出现1-3天的胀痛，程度类似轻度头痛，可通过医生建议的止痛药缓解。
极少数对疼痛敏感者可能在麻醉注射时感到明显不适，或术后出现持续超过3天的显著疼痛。这种情况可能与个体痛阈较低、术后护理不当或罕见的手术并发症有关，需及时联系医生排查感染或血肿等问题。
术后建议保持头部抬高姿势休息，避免剧烈运动或抓挠种植区，按医嘱使用抗菌喷雾预防感染。饮食上多补充优质蛋白如鱼肉、鸡蛋促进毛囊修复，避免辛辣刺激食物。术后1周内避免吸烟饮酒，洗头时使用温和的无硅油洗发水，水温不超过40℃。若出现异常红肿、渗液或持续剧痛，应立即返院检查。通常术后5-7天血痂脱落时不适感会明显减轻，新生毛发在3-6个月后逐渐生长。