心肌炎多数情况下可以根治，但需根据病因、病情严重程度及治疗及时性综合判断。病毒性心肌炎早期规范治疗预后较好，而暴发性心肌炎或合并严重并发症者可能遗留后遗症。
病毒性心肌炎是常见类型，若在发病1-2周内明确诊断并接受抗病毒、营养心肌等治疗，多数患者心肌损伤可完全修复。急性期需绝对卧床休息，避免体力活动加重心脏负荷，常用药物包括辅酶Q10片、磷酸肌酸钠注射液等改善心肌代谢，同时需针对原发病毒感染使用利巴韦林颗粒等抗病毒药物。
部分重症心肌炎患者可能出现心功能持续减退，尤其暴发性心肌炎合并心源性休克时，即使通过主动脉内球囊反搏等生命支持治疗，仍可能遗留扩张型心肌病等后遗症。自身免疫性心肌炎需长期使用糖皮质激素如醋酸泼尼松片控制炎症，病程可能迁延数年。慢性心肌炎患者需定期复查心脏超声评估心功能变化，必要时需终身服用β受体阻滞剂如酒石酸美托洛尔片延缓心室重构。
心肌炎康复期应保持低盐低脂饮食，每日钠盐摄入不超过5克，避免腌制食品。可适量进食富含辅酶Q10的沙丁鱼、菠菜等食物，补充维生素B族促进心肌修复。恢复运动需循序渐进，急性期后3-6个月内避免剧烈运动，定期监测心率变异性和运动耐量。戒烟限酒，保证充足睡眠，冬季注意保暖预防呼吸道感染。若出现活动后气促、下肢水肿等症状需及时复诊。