心肌炎通常可以完全治好，但具体恢复情况与病情严重程度、治疗及时性等因素有关。轻度心肌炎患者经规范治疗后多数可痊愈，重症心肌炎可能遗留心脏功能损伤。
病毒性心肌炎早期发现并接受抗病毒治疗、营养心肌治疗的患者，炎症消退后心肌细胞可逐步修复。临床常用药物包括辅酶Q10片、磷酸肌酸钠注射液、维生素C注射液等，配合卧床休息和低盐饮食，多数患者在3-6个月内恢复。部分患者可能出现一过性心律失常或心肌酶升高，经对症处理后不影响最终预后。
暴发性心肌炎或合并严重心力衰竭的患者，即使通过免疫球蛋白冲击治疗、机械循环支持等抢救措施，仍有概率遗留扩张型心肌病或慢性心功能不全。这类患者需长期服用美托洛尔缓释片、螺内酯片等药物控制病情，定期复查心脏超声评估心功能。
心肌炎康复期应避免剧烈运动，保持每日6-8小时睡眠，限制每日钠盐摄入不超过5克。可适当补充富含ω-3脂肪酸的三文鱼、核桃等食物，有助于心肌修复。若出现活动后胸闷、夜间阵发性呼吸困难等症状需立即复诊。建议每3个月复查心电图和心肌酶谱，持续监测1年以上无异常可视为临床治愈。