灰指甲治疗选择碘酒或碘伏需根据病情严重程度和皮肤耐受性决定。碘酒适用于早期轻度感染但刺激性较强，碘伏更适合中重度感染或皮肤敏感者。
碘酒是含碘和碘化钾的乙醇溶液，杀菌力强但可能损伤皮肤屏障。其高浓度碘可渗透甲板抑制真菌，但频繁使用会导致甲周皮肤干燥脱屑。对于无明显甲床红肿的浅表白斑型灰指甲，可短期隔日使用棉签点涂。碘伏是碘与表面活性剂形成的络合物，刺激性低且作用持久。其缓释碘特性适合甲板增厚超过2毫米的中重度感染，每日2次浸泡患甲5分钟能持续抑制真菌繁殖。合并甲沟炎时优先选用碘伏，可减少对破损皮肤的刺激。
碘酒禁用于碘过敏、甲状腺疾病患者及孕妇。使用后需用75%酒精脱碘避免色素沉着。碘伏与含汞药物同用会产生毒性碘化汞，不可与红药水联用。儿童及老年人甲板薄脆时，碘伏的温和性更利于长期治疗。混合细菌感染时，碘伏的广谱抗菌优势更明显。
灰指甲治疗期间需保持足部干燥通风，每日更换消毒棉袜。避免与他人共用指甲剪等物品，定期煮沸消毒鞋袜。配合口服抗真菌药物时，应监测肝功能指标。治疗周期通常需要3-6个月，新甲完全长出前不可中断用药。建议就医进行真菌培养确定病原体类型，顽固性灰指甲可能需要激光或手术拔甲治疗。