心脏室间隔变厚部分情况下可逆，具体取决于病因和干预时机。可逆性主要与生理性代偿、早期高血压控制或代谢性疾病纠正有关；不可逆情况多见于长期未控制的慢性病或遗传性心肌病。
生理性室间隔增厚如运动员心脏或妊娠期心脏负荷增加，在去除诱因后可能逐渐恢复。高血压导致的室间隔肥厚，若在心肌纤维化前积极降压，部分患者厚度可减轻。代谢异常如甲状腺功能亢进或糖尿病心肌病，纠正原发病后可能改善心肌重构。遗传性肥厚型心肌病或淀粉样变性等疾病，目前尚无有效逆转手段，治疗以延缓进展为主。部分儿童期发现的轻度肥厚，通过早期干预原发病可能获得更好预后。
不可逆情况多见于长期未控制的高血压、主动脉瓣狭窄等压力负荷疾病，心肌细胞已发生不可逆纤维化。晚期肥厚型心肌病即使接受室间隔切除术，心肌结构异常仍持续存在。某些浸润性疾病如血色病或法布里病，心肌损害常为进行性。老年患者的室间隔增厚多与长期心血管风险因素累积相关，逆转可能性较低。
建议存在室间隔增厚者定期进行心脏超声随访，高血压患者需严格控压至130/80毫米汞柱以下，糖尿病患者糖化血红蛋白应维持在7%以内。每日钠盐摄入不超过5克，避免剧烈无氧运动但保持适度有氧活动。出现胸闷、晕厥等症状时需立即就诊，遗传性疾病患者建议家属筛查。对于可逆因素应把握发病初期的黄金干预窗口，不可逆病变则需通过药物和生活方式管理延缓心力衰竭进展。