海棠果的籽少量误食一般不会中毒，但大量食用可能引起氰苷类物质中毒。海棠果籽含有微量氰苷，在人体内可能转化为氢氰酸。
海棠果籽中的氰苷含量较低，偶尔误食几颗通常不会导致中毒反应。人体消化系统对微量氰苷有一定代谢能力，健康成年人少量摄入后可通过尿液排出。日常食用海棠果时若不小心吞下1-2粒籽，无须过度担忧，但需观察是否出现头晕或恶心等不适。
若一次性吞食超过10粒海棠果籽或长期大量摄入，氰苷在体内蓄积可能引发中毒。氢氰酸会抑制细胞呼吸酶活性，导致组织缺氧。早期表现为口苦、头晕、恶心，严重时可出现呼吸困难、意识模糊甚至昏迷。儿童因体重较轻且代谢能力较弱，更易出现中毒症状。建议食用前去除果籽，避免咀嚼或压碎籽粒。
日常食用海棠果建议彻底去除果核，尤其需避免让儿童接触果籽。若误食大量籽粒后出现唇舌麻木、心悸等症状，应立即就医并携带剩余果核供检测。储存海棠果时可将果肉与籽分离冷藏，制作果酱或果汁时需过滤籽粒。选择成熟度高的果实可减少籽粒中氰苷含量，食用后适当饮水有助于代谢产物排出。