大人切除扁桃体的危害通常较小，但需根据个体情况评估手术必要性。扁桃体切除术可能引发短期术后疼痛、出血风险，或影响局部免疫功能。
扁桃体切除术后常见短期不适包括咽喉疼痛、吞咽困难，一般持续1-2周可缓解。手术创面可能出现少量渗血，需避免剧烈咳嗽或进食硬质食物。部分患者可能出现暂时性味觉改变或耳部牵涉痛，多与神经末梢刺激有关。术后需注意口腔清洁，使用生理盐水漱口降低感染概率。少数患者因扁桃体缺失可能增加上呼吸道感染频率，但多数可通过其他免疫组织代偿。
长期影响方面，成人切除扁桃体后极少出现免疫功能显著下降。扁桃体作为次级淋巴器官，其功能可被咽部其他淋巴组织部分替代。但慢性咽炎患者术后可能遗留咽部异物感，过敏体质者需加强鼻腔护理。术前存在睡眠呼吸暂停的患者，术后需评估症状改善情况。罕见情况下，瘢痕体质者可能出现咽部组织粘连，需通过康复训练改善。
术后应保持流质饮食3-5天，逐步过渡至软食，避免辛辣刺激性食物。每日饮水2000毫升以上有助于创面恢复，可使用加湿器维持咽喉湿润。两周内禁止剧烈运动或高空作业，睡眠时抬高床头减少肿胀。定期复查确认愈合情况，出现持续出血、高热或呼吸困难需立即就医。长期可适当补充维生素C和锌元素增强黏膜修复，冬季注意佩戴口罩预防呼吸道感染。