慢性咽炎和鼻炎通常可以控制症状或临床治愈，但难以彻底根治。治疗需结合病因管理、药物干预及生活方式调整。
慢性咽炎和鼻炎的治疗效果与病因密切相关。感染性因素引起的炎症在规范抗感染治疗后可能达到临床治愈，如细菌性鼻炎使用阿莫西林克拉维酸钾片、头孢克洛分散片等抗生素控制感染后症状可消失。过敏因素导致的疾病通过避免接触过敏原、使用糠酸莫米松鼻喷雾剂等药物可有效控制症状，但易反复发作。结构性病变如鼻中隔偏曲合并慢性鼻炎，经鼻内镜下矫正手术后症状可显著改善。
部分患者因长期吸烟、空气污染或职业暴露等因素导致黏膜持续损伤，即使规范治疗仍可能遗留咽干、鼻塞等症状。胃食管反流相关的咽炎需联合抑酸药物如奥美拉唑肠溶胶囊治疗原发病。自身免疫性疾病继发的鼻炎咽炎往往需要长期免疫调节治疗，症状控制难度较大。
慢性咽炎和鼻炎患者应保持室内湿度40%-60%，每日饮水1500-2000毫升，避免辛辣刺激食物。建议进行鼻腔冲洗每日1-2次，戒烟并远离粉尘环境。适度运动如八段锦可增强上呼吸道免疫力，寒冷季节外出佩戴口罩。症状持续加重或出现血性分泌物时需及时耳鼻喉科复查，必要时行喉镜或鼻窦CT检查排除其他病变。