肠镜检查通常是一种安全的医疗操作，但可能存在少数潜在风险。肠镜主要用于检查肠道病变，过程中可能出现轻微不适或并发症。
肠镜检查过程中，患者可能会感到腹胀或轻微腹痛，这是由于检查时向肠道内充气以扩张肠腔所致。部分患者在检查后可能出现短暂肛门不适或少量出血，多与活检或息肉切除操作有关。极少数情况下可能发生肠穿孔或出血量较多，需要及时医疗干预。检查前清洁肠道可能引起脱水或电解质紊乱，尤其老年患者需注意补充水分。麻醉药物可能引发过敏反应或呼吸抑制，但麻醉师会全程监测生命体征。
存在严重心肺疾病、凝血功能障碍或肠道急性炎症的患者风险相对较高。近期接受过腹部手术或肠道放疗者可能增加穿孔概率。妊娠期女性除非必要应避免肠镜检查。对镇静药物过敏史者需提前告知医生。肠道准备不充分可能导致检查失败或遗漏病变。
检查前应严格遵医嘱进行肠道准备，避免进食红色食物影响观察。检查后2小时内禁食禁水以防误吸，当日避免驾驶或精密操作。出现持续腹痛、发热或便血需立即就医。日常保持高纤维饮食和规律排便习惯有助于肠道健康，40岁以上人群建议定期进行肠癌筛查。术后恢复期间可适量补充益生菌调节肠道菌群，但避免剧烈运动或提重物。