宝宝体温39摄氏度持续一晚上可能会引起身体损伤，但具体是否造成严重损害需结合其他症状综合判断。高热可能由感染、免疫反应等因素引起，建议家长及时监测并就医。
婴幼儿体温调节中枢发育不完善，持续高热可能导致代谢紊乱。当体温超过38.5摄氏度时，体内酶活性可能受影响，持续6-8小时以上可能出现脱水、电解质失衡。部分患儿会出现热性惊厥，表现为四肢抽搐、意识丧失，这种情况需要立即就医。
少数情况下，超高热超过40摄氏度且持续时间较长时，可能对神经系统造成不可逆损伤。但多数患儿在及时降温处理后不会遗留后遗症。需要特别关注3个月以下婴儿、有基础疾病或出现嗜睡、呕吐、皮疹等伴随症状的情况，这些属于高危指征。
家长应保持环境通风，使用温水擦浴等物理降温方式，避免包裹过厚衣物。可遵医嘱使用对乙酰氨基酚口服混悬液或布洛芬混悬液等退热药物，但不要交替使用不同退热药。发热期间需少量多次补充水分，观察尿量及精神状态。若高热持续不退或出现惊厥、呼吸困难等症状，须立即前往儿科急诊。退热后仍需监测体温变化，注意有无咳嗽、腹泻等新发症状。