针灸治疗肩痛通常无明显副作用，但少数情况下可能出现局部淤青、晕针或感染等不良反应。针灸通过刺激穴位调节气血运行，对肩周炎、颈椎病等引起的肩痛有缓解作用。
针灸作为传统中医疗法，其副作用发生率较低。操作规范时，针具严格消毒可避免感染风险，医师会根据个体差异控制针刺深度和刺激强度，减少出血或局部疼痛。部分敏感人群可能出现短暂性头晕、乏力等晕针反应，平卧休息后多可自行缓解。
存在凝血功能障碍或皮肤感染的患者，针灸可能加重皮下出血或引发炎症扩散。糖尿病患者因末梢循环较差，需谨慎选择针刺部位。孕妇肩部某些穴位可能刺激子宫收缩，应提前告知医师妊娠状态。针灸后24小时内避免接触冷水或剧烈运动，有助于降低不良反应概率。
进行针灸治疗前应选择正规医疗机构，确保医师具备执业资质。治疗期间保持肩部保暖，可配合热敷促进血液循环。若出现持续肿胀或发热症状应及时复诊，避免自行处理针孔。日常可进行肩关节环转运动预防粘连，睡眠时避免压迫患侧肩膀。