肛周脓肿不一定必须手术，部分早期病例可通过抗生素治疗控制感染，但多数情况下需手术引流脓液。
肛周脓肿是肛腺感染后形成的局部化脓性病变，其治疗方式与病情进展阶段密切相关。对于早期发现的局限性小脓肿，尚未形成明显波动感时，医生可能尝试采用头孢克肟分散片、甲硝唑片等抗生素控制感染，配合高锰酸钾坐浴等保守治疗。这类患者需密切观察体温、疼痛变化，若用药后48小时内症状无改善或持续加重，仍需考虑手术干预。
临床中约八成肛周脓肿患者因就诊时已形成成熟脓腔，需接受切开引流术或根治性手术。脓腔直径超过3厘米、伴有高热等全身症状者必须手术，否则可能引发败血症或肛瘘。糖尿病患者、免疫力低下者等特殊人群更需积极手术干预。术后需每日换药至创面愈合，期间可能出现暂时性肛门失禁，但多数在1-2个月内恢复。
肛周脓肿患者无论是否手术，均需保持肛门清洁，每日用温水清洗后擦干，避免久坐压迫患处。饮食应选择小米粥、蒸南瓜等低渣食物，减少辛辣刺激食物摄入。术后恢复期可进行提肛运动锻炼括约肌功能，但需避免剧烈运动导致创面出血。若发现肛门持续渗液、创面红肿或发热，应立即返院复查。未手术者若保守治疗期间出现排便困难、肛门坠胀感加重，提示可能进展为肛瘘，需及时复查肛门超声明确病情。