慢性鼻咽炎通常无须手术治疗，多数患者可通过药物治疗和生活方式调整控制症状。手术治疗仅适用于药物难治性病例或存在结构性异常者。
慢性鼻咽炎的治疗以保守治疗为主。鼻腔冲洗可清除分泌物和过敏原，减轻黏膜炎症。鼻用糖皮质激素喷雾剂如布地奈德鼻喷雾剂能有效缓解黏膜水肿和炎症反应。口服抗组胺药如氯雷他定片适用于过敏因素导致的鼻咽炎。合并细菌感染时需短期使用抗生素如阿莫西林克拉维酸钾片。对于长期鼻塞患者，可短期使用减充血剂如盐酸赛洛唑啉鼻喷雾剂。
当患者存在鼻中隔偏曲、鼻息肉等解剖结构异常，或药物治疗3-6个月无效时需考虑手术。功能性内镜鼻窦手术可矫正解剖异常并开放鼻窦引流通道。腺样体切除术适用于儿童腺样体肥大导致的顽固性鼻咽炎。术后仍需配合药物治疗和定期复查，防止复发。
慢性鼻咽炎患者应保持室内湿度40%-60%，避免接触粉尘和冷空气刺激。饮食宜清淡，限制辛辣食物和酒精摄入。规律进行有氧运动可增强上呼吸道抵抗力，建议每周3-5次30分钟快走或游泳。吸烟者必须戒烟，被动吸烟环境同样需要避免。出现症状加重或持续不缓解时，应及时到耳鼻咽喉科复诊评估治疗方案。