先天性心肌炎通过规范治疗可以控制症状并改善预后，但难以完全根治。治疗方式主要有抗病毒治疗、免疫调节、心力衰竭管理、心律失常控制和长期随访监测。
1、抗病毒治疗
部分先天性心肌炎与宫内病毒感染有关，确诊后可使用更昔洛韦注射液等抗病毒药物抑制病毒复制。治疗期间需监测肝肾功能，若出现心肌酶持续升高或心功能恶化需调整方案。病毒清除后心肌损伤可能逐步修复，但遗留的心肌纤维化不可逆。
2、免疫调节
对于自身免疫性心肌炎，采用静脉注射用人免疫球蛋白冲击治疗或醋酸泼尼松片调节免疫反应。治疗需持续3-6个月，期间定期复查超声心动图评估心室收缩功能。免疫抑制剂使用期间需预防机会性感染。
3、心力衰竭管理
出现心功能下降时需联合使用酒石酸美托洛尔缓释片、呋塞米片和螺内酯片进行抗心衰治疗。严重病例可短期应用重组人脑利钠肽改善血流动力学。所有药物需根据体重精确调整剂量，避免低血压或电解质紊乱。
4、心律失常控制
合并室性心律失常者可选用盐酸胺碘酮片，房室传导阻滞需安装临时起搏器。药物治疗无效的顽固性室速可考虑射频消融术。动态心电图监测应每3个月重复进行，尤其关注QT间期变化。
5、长期随访监测
患儿需终身定期复查心脏磁共振和运动负荷试验，监测心肌瘢痕进展。建议避免剧烈运动，预防呼吸道感染。青春期后需重新评估心功能状态，部分患者成年后可能需心脏移植。
先天性心肌炎患儿日常需保持低盐饮食，每日钠摄入不超过2克。建议接种流感疫苗和肺炎球菌疫苗预防感染。家长应学会监测静息心率，记录每日尿量和体重变化。睡眠时保持半卧位可减轻呼吸困难，出现口唇发绀或喂养困难需立即就医。康复期可在医生指导下进行水中步行等低强度运动。