慢性咽喉炎通常难以彻底断根，但通过规范治疗和长期管理可有效控制症状。慢性咽喉炎的治疗效果与病因控制、生活习惯调整等因素密切相关。
慢性咽喉炎的治疗效果因人而异。若由长期吸烟、饮酒或胃酸反流等可逆因素引起，消除诱因后症状可能显著缓解甚至消失。但若病因与职业暴露、过敏体质或免疫异常相关，则需长期对症处理。咽喉黏膜在反复炎症刺激下可能出现不可逆损伤，此时治疗目标转为减轻症状和预防急性发作。
部分患者通过中药调理、雾化吸入等综合疗法可实现较长时间无症状期，但受凉、疲劳等诱因仍可能导致复发。伴有鼻窦炎、扁桃体隐窝感染等病灶者，需同步处理原发病才能改善预后。自身免疫性疾病相关的咽喉炎需终身管理基础疾病。
慢性咽喉炎患者应避免辛辣刺激饮食，保持室内湿度，戒烟限酒，规律作息。用淡盐水漱口有助于清洁咽喉，但不宜过度。建议每半年复查喉镜，监测黏膜变化。合并胃食管反流者需睡前3小时禁食，抬高床头。教师、歌手等职业用嗓人群应掌握正确发声方法，必要时使用扩音设备。冬季注意颈部保暖，流感季节前接种疫苗可减少急性发作概率。