小孩拉肚子一般可以吃益生菌，有助于调节肠道菌群平衡。但需注意益生菌种类选择及是否伴随其他症状。
儿童腹泻时，肠道内有害菌可能增多，导致菌群失调。部分益生菌如双歧杆菌、乳酸杆菌等能竞争性抑制致病菌生长，促进肠黏膜修复。临床常用枯草杆菌二联活菌颗粒、酪酸梭菌活菌散等药品，需在医生指导下使用。若腹泻由轮状病毒感染引起，益生菌可缩短病程。对于乳糖不耐受导致的腹泻，部分益生菌能辅助分解乳糖。
但细菌性痢疾或严重感染性腹泻时，单纯补充益生菌效果有限，需联合抗生素治疗。免疫缺陷患儿使用活菌制剂存在风险。益生菌与抗菌药物需间隔2小时服用，避免活性被破坏。部分益生菌含乳制品成分，牛奶蛋白过敏儿童需谨慎选择。
儿童腹泻期间应注意补充口服补液盐预防脱水，母乳喂养可继续，配方奶喂养可暂时改用无乳糖配方。避免高糖、高脂饮食，可进食米汤、苹果泥等低渣食物。注意餐具消毒与手部清洁，观察大便性状与尿量变化。若出现持续发热、血便、精神萎靡等症状应立即就医。益生菌作为辅助治疗手段，不能替代病因治疗与液体补充。