脊髓灰质炎疫苗的副作用通常较轻微，可能出现注射部位红肿、低热、食欲减退等反应，严重过敏反应罕见。脊髓灰质炎疫苗包括口服减毒活疫苗和注射灭活疫苗两种，不良反应类型与个体差异有关。
接种后24小时内可能出现注射部位疼痛、发红或硬结，一般1-3天自行消退。部分受种者会出现37.5-38.5℃的低热，多伴随轻微烦躁或嗜睡，通常通过物理降温即可缓解。胃肠道反应如食欲下降、恶心等多见于口服疫苗，持续1-2天后消失。这些反应属于疫苗激活免疫系统的正常生理现象，无须特殊处理。
极少数情况下可能发生高热超过39℃、持续性哭闹或过敏反应。过敏表现为皮疹、面部肿胀或呼吸困难，多发生在接种后30分钟内。疫苗相关麻痹型脊髓灰质炎发生率极低，约百万分之一，多见于免疫功能缺陷者。若出现惊厥、肢体无力或过敏症状需立即就医。
接种后应在现场留观30分钟，出现发热可适量补液并监测体温。避免当日剧烈运动，保持接种部位清洁干燥。对疫苗成分过敏、急性发热性疾病患者应暂缓接种。哺乳期妇女与早产儿需医生评估后接种，免疫功能低下者推荐选择灭活疫苗。若不良反应持续超过72小时或加重，应及时联系接种单位。