切除腺样体可能引发短期并发症和长期免疫功能影响，但多数情况下手术获益大于风险。主要潜在危害包括术后出血、感染、鼻咽部粘连、中耳炎复发风险增加以及免疫功能暂时性下降。
术后出血通常发生在24小时内，与手术创面渗血或凝血功能异常有关，需及时压迫止血或电凝处理。感染多表现为发热、咽痛加剧，常见病原体为链球菌和葡萄球菌，需使用抗生素控制。鼻咽部粘连可能导致鼻腔通气障碍，术中精细操作和术后定期清理可降低发生概率。腺样体作为鼻咽部免疫组织，其切除后可能暂时降低局部IgA分泌，但周围淋巴组织会逐渐代偿其功能。部分患儿可能出现咽鼓管功能暂时性失调，增加渗出性中耳炎复发机会。
极少数情况下可能发生颈椎半脱位或寰枢椎旋转性移位，与术中过度仰头体位相关。特殊体质患者可能出现瘢痕增生导致鼻咽部狭窄，需二次手术干预。免疫功能低下患儿术后可能更易发生呼吸道反复感染，需加强免疫调节治疗。
术后应保持口腔清洁，使用生理盐水漱口，避免剧烈咳嗽和擤鼻动作。饮食从流质逐渐过渡到软食，保证优质蛋白摄入促进创面愈合。定期复查鼻咽镜观察愈合情况，监测听力变化。出现持续发热、剧烈疼痛或大量鼻出血需立即就医。多数儿童在术后3-6个月免疫功能可完全代偿，术前应充分评估手术指征并做好术后护理方案。