甲硝唑可以用于治疗部分由厌氧菌感染引起的牙疼，但对其他原因导致的牙疼无效。牙疼可能与龋齿、牙髓炎、根尖周炎、智齿冠周炎、牙周脓肿等因素有关。
甲硝唑是一种硝基咪唑类抗生素，对厌氧菌具有较强的抗菌作用。当牙疼由厌氧菌感染引起时，如智齿冠周炎、牙周脓肿等，使用甲硝唑可能有助于缓解症状。这类感染通常伴随牙龈红肿、局部化脓、口腔异味等表现。但甲硝唑对需氧菌无效，也无法改善非感染性牙疼。
由龋齿、牙髓炎或非细菌性炎症引起的牙疼，甲硝唑通常没有治疗效果。龋齿导致的疼痛多与牙体缺损刺激神经有关；牙髓炎常由物理或化学因素引发；而根尖周炎早期可能仅表现为咬合不适。这些情况需通过补牙、根管治疗或消炎镇痛药物处理，单纯使用抗生素无法解决问题。
出现牙疼时应先明确病因，避免自行用药。甲硝唑需在医生指导下使用，不可长期服用。孕妇、哺乳期女性及肝功能异常者禁用。治疗期间应保持口腔卫生，避免辛辣刺激食物。若服药后疼痛未缓解或加重，需及时就医排查其他病因。