甲硝唑治疗牙疼效果较好，主要与其抗菌谱覆盖牙周感染常见厌氧菌、抑制炎症介质释放、穿透组织能力强等因素有关。
1、针对厌氧菌感染
甲硝唑对牙龈卟啉单胞菌、普氏菌等牙周致病厌氧菌有高度抗菌活性，这类细菌是牙髓炎、根尖周炎的主要病原体。其硝基还原酶能将药物转化为细胞毒性物质，直接破坏细菌DNA结构。
2、抗炎作用显著
甲硝唑可通过抑制白细胞趋化和超氧化物产生，减少前列腺素E2等炎症介质释放，缓解牙周组织肿胀疼痛。对急性根尖周炎引发的剧烈跳痛效果尤为明显。
3、组织渗透性强
药物脂溶性高，能快速穿透牙槽骨到达根尖周组织，在脓液中仍能保持有效浓度。与骨组织亲和力强，特别适合治疗颌骨骨髓炎等深部感染。
4、协同增效作用
与阿莫西林克拉维酸钾片、头孢克肟分散片等β-内酰胺类抗生素联用时，可扩大抗菌谱覆盖需氧菌，提高对混合感染的治疗效果。
5、耐药率较低
相比克林霉素磷酸酯片等抗生素，厌氧菌对甲硝唑的耐药突变率较低。规范使用甲硝唑片时不易诱导耐药，适合反复发作的慢性牙周炎患者。
使用甲硝唑期间应避免饮酒，防止双硫仑样反应。治疗牙疼时建议配合布洛芬缓释胶囊等非甾体抗炎药镇痛，但须在医生指导下联合用药。日常需保持口腔卫生，使用含氯己定的漱口水辅助控制菌斑，定期进行牙周洁治。若用药3天后疼痛未缓解或出现口唇麻木等神经系统症状，应立即停用并就医。