会厌囊肿一般不会癌变，但存在极少数恶变可能。会厌囊肿多为良性病变，通常由黏液腺管阻塞或慢性炎症刺激引起，若囊肿持续增大或反复感染需警惕病理变化。
会厌囊肿属于喉部常见的潴留性囊肿，多因会厌黏膜下腺体导管阻塞导致黏液积聚形成。囊肿较小且无症状时通常无需特殊处理，定期观察即可。临床表现为咽喉异物感、吞咽不适或发音含糊，可通过喉镜检查确诊。囊肿生长缓慢，表面光滑且边界清晰，病理检查可见囊壁内衬复层鳞状上皮或假复层纤毛柱状上皮，囊液多为黏稠分泌物。多数患者通过手术切除可治愈，术后复发概率较低。
极少数情况下，长期存在的会厌囊肿可能因持续炎症刺激发生上皮异常增生。若囊肿体积短期内迅速增大、表面出现溃疡或伴有颈部淋巴结肿大，需考虑恶变倾向。病理学检查发现细胞异型性、核分裂象增多或浸润性生长时，需按早期喉癌进行扩大切除并配合放疗。吸烟、酗酒或人乳头瘤病毒感染可能增加恶变风险。
建议确诊会厌囊肿后每6-12个月复查电子喉镜，避免辛辣食物刺激咽喉黏膜。若出现持续性声音嘶哑、痰中带血或呼吸困难等症状应及时就诊，喉显微手术可完整切除囊肿并送病理检查以明确性质。术后需保持口腔清洁，避免用力咳嗽或清嗓动作，减少声带损伤。