全身麻醉的副作用通常较轻微且可控，多数情况下不会对身体造成长期影响。全身麻醉可能引起恶心呕吐、咽喉不适、短暂认知障碍等反应，极少数情况下可能出现严重并发症。
全身麻醉后较常见的副作用是术后恶心呕吐，与麻醉药物刺激呕吐中枢、胃肠蠕动减缓有关，通常24小时内自行缓解。咽喉不适多因气管插管操作导致黏膜轻微损伤，表现为吞咽疼痛或声音嘶哑，一般3天内恢复。部分患者可能出现短暂记忆力下降或注意力不集中，尤其老年人群，这与麻醉药物对中枢神经的暂时性抑制相关，多数1周内逐渐改善。
严重并发症如恶性高热、呼吸循环衰竭等发生概率极低，多与患者基础疾病或遗传因素相关。恶性高热表现为麻醉后体温急剧升高、肌肉强直，需立即使用特效药物丹曲林钠注射液抢救。术前全面评估心肺功能、药物过敏史可显著降低风险。有睡眠呼吸暂停综合征或严重心脑血管疾病者需提前告知麻醉医师调整方案。
术后应保持呼吸道通畅，避免过早进食饮水以防误吸。家属需协助记录患者意识状态变化，出现持续头痛、呼吸困难或胸痛需立即通知医护人员。恢复期保证充足睡眠有助于代谢麻醉药物残留，短期内避免驾驶或高空作业等需高度集中注意力的活动。均衡饮食补充蛋白质和维生素可促进伤口愈合，定期随访复查肝肾功能。