输尿管结石通常可以彻底治愈，治疗方法包括药物排石、体外冲击波碎石术、输尿管镜碎石术等。结石能否彻底清除取决于结石大小、位置以及患者个体差异。
直径小于6毫米的结石通过大量饮水、适度运动及药物辅助治疗，多数可自行排出。常用药物包括排石颗粒、尿石通丸、肾石通颗粒等，这些药物能松弛输尿管平滑肌、促进尿液排出。部分患者可能伴随肾绞痛症状，可遵医嘱使用双氯芬酸钠栓或布洛芬缓释胶囊缓解疼痛。治疗期间需定期复查泌尿系统超声，确认结石是否完全排出。
直径超过6毫米的结石可能需要体外冲击波碎石术，该技术通过高能冲击波将结石粉碎成小颗粒后随尿液排出。对于嵌顿性结石或冲击波碎石失败者，可采用输尿管镜钬激光碎石术，通过尿道置入内镜直接粉碎并取出结石。术后可能留置双J管1-2周以防止输尿管狭窄，期间可能出现轻微血尿或尿频症状。
极少数复杂性结石需经皮肾镜取石术或多学科联合治疗，这种情况常见于合并解剖异常、肾功能不全或感染性结石患者。感染性结石治愈后需长期服用枸橼酸氢钾钠颗粒调节尿液酸碱度，并定期检测尿常规预防复发。
输尿管结石治愈后应保持每日2000-3000毫升饮水量，限制高草酸食物如菠菜、浓茶，适当补充柑橘类水果。建议每半年复查泌尿系统超声，有结石家族史或代谢异常者需进行24小时尿液成分分析。突发剧烈腰痛伴血尿时应及时就医，避免延误治疗导致肾积水或肾功能损害。