先天性心脏病一般不能自愈，但部分简单型缺损可能随年龄增长自然闭合。先天性心脏病的预后与缺损类型、严重程度及是否合并其他畸形有关，需通过专业评估确定干预方案。
房间隔缺损、室间隔缺损等简单型先心病存在自然闭合概率，多见于缺损较小且位置特殊的患儿。这类患儿在出生后1-2年内可能出现缺损边缘组织增生，逐渐形成闭合。但自然闭合过程需要定期心脏超声监测，期间仍需预防呼吸道疾病，避免肺动脉高压等并发症。动脉导管未闭在早产儿中也有较高概率自行闭合，但足月儿通常需要药物或手术干预。
复杂型先心病如法洛四联症、大动脉转位等均无法自愈，需在婴幼儿期进行手术矫正。部分患儿虽暂时无症状，但心脏异常血流会导致继发性肺动脉高压、心力衰竭等不可逆损害。即使简单型缺损未闭合，长期存在的左向右分流也可能引起心脏扩大，需在学龄前完成介入封堵或外科修补。
建议所有先心病患儿每3-6个月复查心脏超声，监测缺损变化与心功能状态。母乳喂养可帮助早产儿动脉导管闭合，婴幼儿期需重点预防肺炎等感染。出现口唇青紫、喂养困难等症状时应立即就医，避免延误手术时机。术后患者仍需终身随访，关注心律失常、瓣膜反流等远期并发症。