小便刺痛能否自愈取决于病因，部分轻微情况可能自行缓解，但多数需针对性治疗。小便刺痛可能与尿路感染、尿道结石、前列腺炎、尿道损伤、性传播疾病等因素有关。
尿路感染是常见原因，细菌侵入尿道引发炎症反应，典型表现为排尿灼热感伴尿频尿急。轻微感染时通过多饮水冲刷尿道可能缓解症状，但未彻底清除病原体易复发。尿道结石移动划伤黏膜可导致刺痛，小结石可能随尿液排出后症状消失，但较大结石需体外碎石或手术干预。前列腺炎引起的排尿不适在急性期可能伴随发热，慢性炎症症状反复，单纯休息难以根治。
性传播疾病如淋病引起的尿道刺痛具有传染性，必须规范使用抗生素治疗。尿道机械性损伤后若继发感染，局部红肿加剧疼痛，需预防性抗感染。糖尿病等慢性病患者出现小便刺痛时，往往存在复杂病因混合作用，自愈概率更低。
建议出现持续超过24小时的小便刺痛及时就医，留取清洁中段尿进行化验。治疗期间保持每日饮水量2000毫升以上，避免辛辣食物刺激尿道。性生活前后注意清洁，选择棉质透气内裤减少局部潮湿。老年患者或孕妇出现症状应优先就诊，不可依赖自愈。