眼皮上的囊肿可能会自己消失，具体与囊肿类型和病情严重程度有关。常见的有睑板腺囊肿和皮脂腺囊肿，部分可自行吸收，部分需医疗干预。
睑板腺囊肿早期体积较小时，可能通过热敷促进腺体疏通，使分泌物排出后逐渐消退。保持眼部清洁、避免揉眼有助于减少继发感染。若囊肿伴随红肿疼痛，提示存在炎症反应，需配合抗生素眼膏如红霉素眼膏控制感染。皮脂腺囊肿囊壁完整且无感染时，部分可被人体缓慢吸收，但过程可能持续数周至数月。囊肿体积较大或反复发作时，自行消退概率降低，可能需手术切除。
囊肿若持续增大压迫眼球导致视物模糊、反复破溃流脓或形成肉芽肿，通常无法自愈。此类情况多与腺体导管结构异常或慢性炎症相关，需通过睑板腺囊肿刮除术等治疗。糖尿病患者或免疫力低下人群的囊肿更易继发感染，自愈可能性较小。儿童睑板腺囊肿因代谢旺盛，部分病例在青春期后可能自行萎缩。
日常避免使用油腻护肤品刺激眼睑，出现囊肿增大或影响视力时应及时就医。术后患者需按医嘱使用左氧氟沙星滴眼液预防感染，定期复查腺体功能。饮食注意减少高糖高脂摄入，适量补充维生素A有助于维持睑板腺健康。