婴儿房间隔缺损有自愈可能，具体与缺损大小、位置及是否合并其他心脏畸形有关。小型继发孔型房间隔缺损在1岁前闭合概率较高，而大型缺损或原发孔型缺损通常需要医疗干预。
小型房间隔缺损直径小于5毫米时，随着婴儿生长发育，心脏结构可能自然闭合。这类缺损通常不会引起明显症状，仅在体检时发现心脏杂音。定期心脏超声检查可监测缺损变化，多数患儿在2岁前实现自愈。喂养时注意少量多次，避免过度哭闹增加心脏负担。
缺损超过8毫米或位于特殊部位时自愈概率显著降低。原发孔型缺损常合并房室瓣畸形，需在6-12个月龄进行手术修补。合并肺动脉高压或反复呼吸道感染的患儿，需提前评估手术指征。术后需预防感染性心内膜炎，疫苗接种应按计划完成。
建议每3-6个月复查心脏超声，观察缺损变化情况。母乳喂养有助于增强免疫力，避免接触呼吸道感染人群。若出现喂养困难、多汗、体重不增等表现，应及时就诊心功能评估。房间隔缺损患儿进行预防接种时无须特殊禁忌，但需告知医生心脏病史。