真菌感染肺炎一般可以治愈，但具体治疗效果与感染真菌种类、患者免疫状态及治疗时机等因素有关。常见致病真菌包括念珠菌、曲霉菌、隐球菌等，临床多采用抗真菌药物联合支持治疗。
针对免疫功能正常的患者，早期规范使用抗真菌药物通常可获得较好疗效。例如肺念珠菌感染可选用氟康唑注射液、伏立康唑片或卡泊芬净注射液，疗程需持续至临床症状消失且影像学改善。治疗期间需监测肝肾功能，避免药物不良反应。合并基础疾病如糖尿病者需同步控制血糖，减少真菌繁殖条件。多数患者在2-4周治疗后病灶逐渐吸收。
对于免疫功能低下人群如艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂者，治疗难度相对增大。肺隐球菌感染需延长两性霉素B脂质体联合氟胞嘧啶的治疗周期，部分病例需持续用药数月。曲霉菌感染易出现组织坏死，必要时需在伏立康唑治疗基础上行支气管镜灌洗清除分泌物。重症患者可能遗留局限性肺纤维化，但通过后续康复训练可改善肺功能。
真菌感染肺炎治愈后应加强预防复发措施。保持居住环境干燥通风，避免接触霉变物质。糖尿病患者需规律监测血糖，长期使用激素或免疫抑制剂者应定期进行胸部影像学复查。出现反复咳嗽、低热等症状时需及时就医排查真菌再感染。日常可适当补充优质蛋白和维生素A，帮助维持呼吸道黏膜屏障功能。