早上起来不刷牙直接喝水是可以的，但建议先漱口再喝水更符合卫生习惯。口腔经过一夜可能滋生细菌，直接喝水可能将部分细菌带入消化道。
夜间睡眠时唾液分泌减少，口腔自洁作用减弱，细菌容易在牙齿表面和舌苔上繁殖。此时直接喝水可能将部分细菌冲刷至胃肠道，但对健康人群的消化系统通常不会造成明显影响。晨起后口腔可能残留食物残渣或代谢产物，清水能帮助稀释口腔酸性环境，短暂缓解口干症状。部分人群习惯空腹饮用温水促进肠道蠕动，这种习惯与刷牙顺序无直接冲突。
存在牙龈炎或龋齿等口腔疾病时，细菌数量会显著增加。未清洁口腔直接喝水可能增加致病菌进入消化道的概率，对于免疫力低下者存在潜在风险。佩戴活动义齿者夜间可能积累更多菌斑，直接饮水时可能将微生物带入体内。糖尿病患者口腔环境更易滋生细菌，需特别注意晨起口腔清洁。
建议养成晨起先漱口再饮水的习惯，可使用清水或淡盐水简单清洁口腔。刷牙能更有效清除牙菌斑，最好在饮水后30分钟再进行彻底刷牙以避免釉质软化期受损。日常注意睡前彻底清洁牙齿，减少夜间细菌繁殖。若长期存在口腔异味或黏膜异常，应及时就诊检查。