卵巢囊肿可能影响月经，具体影响程度与囊肿类型、大小及是否伴随激素分泌异常有关。功能性卵巢囊肿如黄体囊肿、滤泡囊肿可能导致月经周期紊乱或经量改变，而病理性囊肿如子宫内膜异位囊肿常伴随痛经或经期延长。若囊肿压迫卵巢组织或干扰激素分泌，可能进一步导致月经异常。
功能性卵巢囊肿多与生理周期相关，如滤泡囊肿因卵泡未破裂持续存在，可能延迟月经来潮或导致经量减少；黄体囊肿因黄体持续分泌孕激素，可能引发经期延长或点滴出血。这类囊肿通常体积较小，多数在2-3个月经周期内自行消退，月经异常症状随之缓解。病理性囊肿中，子宫内膜异位囊肿因异位内膜组织周期性出血，常引发严重痛经、经量增多或经期不规则，且症状呈进行性加重。卵巢浆液性或黏液性囊腺瘤等肿瘤性囊肿若体积超过5厘米，可能通过机械压迫影响卵巢血流，导致月经稀发甚至闭经。
部分特殊类型囊肿如多囊卵巢综合征相关的多发小卵泡，会因持续无排卵导致月经稀发、闭经，同时伴随雄激素升高症状如痤疮、多毛。卵巢颗粒细胞瘤等分泌雌激素的肿瘤则可能引起月经频发、经期延长等雌激素过剩表现。极少数情况下，巨大卵巢囊肿扭转或破裂引发的急性腹痛可能被误认为痛经，需通过超声检查鉴别。
建议存在月经异常合并下腹坠胀、性交痛等症状者及时进行妇科超声和激素六项检查。日常避免高雌激素食物如蜂王浆，规律作息以维持内分泌稳定，剧烈腹痛需立即就医排除囊肿并发症。确诊病理性囊肿后应根据医生建议选择药物抑制或腹腔镜手术切除，功能性囊肿可每3-6个月复查超声观察变化。