小飞虫进入鼻腔后通常会被鼻腔分泌物粘附并随鼻涕排出，少数情况下可能进入气管或消化道。鼻腔内的鼻毛和黏液能阻挡并清除大部分异物，但若出现持续不适需及时就医。
小飞虫进入鼻腔后，鼻腔内的鼻毛会首先阻挡其深入，同时鼻腔黏膜分泌的黏液会包裹住飞虫。在人体正常的生理反射如打喷嚏或擤鼻涕时，飞虫会随黏液一起被排出体外。这一过程是人体自我保护机制的一部分，多数情况下不会对健康造成影响。鼻腔结构呈弯曲状且有较多皱襞，飞虫难以通过鼻腔进入更深部位。
极少数情况下，若飞虫体积较小或进入时伴随剧烈吸气动作，可能突破鼻腔防线进入气管或消化道。进入气管可能引发剧烈咳嗽等保护性反射将异物咳出，若进入消化道通常会被胃酸分解。但若飞虫带有病原体或引发过敏反应，可能出现局部炎症或过敏症状，如持续鼻塞、流脓涕、面部疼痛或呼吸困难等表现时需立即就医处理。
日常生活中应避免在蚊虫多的地方张大嘴巴呼吸，户外活动时可佩戴口罩防护。若怀疑异物残留鼻腔，不要自行掏挖以免将异物推入更深部位，可尝试用生理盐水冲洗鼻腔。出现持续鼻部不适、呼吸异常或发热等症状时，应及时到耳鼻喉科就诊，医生可通过鼻内镜检查明确情况并进行专业处理。