现代医学对肛门湿疹的看法有很多，但不外以下两个方面：
①外因方面：外界刺激，如太阳光线、紫外线、寒冷、炎热、干燥、多汗、搔抓、摩擦、生存环境、气候变化、动物皮毛、植物、化学物质和日常生活用品如化妆品、肥皂、人造纤维等的刺激，都可引起湿疹。
②内因方面：某些慢性消化系统疾病、胃肠道功能障碍、精神紧张、失眠、过度疲劳、情绪波动以及新陈代谢障碍、内分泌功能失调等，均可引起或加重湿疹的病情。此外，肛瘘、肛裂、痔疮等也可引起肛门湿疹。
同时，肛门湿疹的发病个体差异较大，因此，认为湿疹与遗传因素和素质有一定关系。