肛周脓肿多数情况下通过规范治疗可以一次根治，具体效果与脓肿范围、治疗时机、患者体质、是否形成肛瘘等因素有关。
1. 脓肿范围
小型浅表脓肿通过切开引流配合抗感染治疗可根治，范围超过3厘米的复杂性脓肿需扩大清创。
2. 治疗时机
早期未化脓阶段采用抗生素可能控制感染，已形成脓腔者延迟手术会导致感染扩散。
3. 患者体质
糖尿病患者需同步控制血糖，免疫力低下者易复发，需加强术后营养支持。
4. 肛瘘形成
约30％病例合并肛瘘需同期行瘘管切除术，否则可能反复发作。
术后保持肛门清洁干燥，避免久坐久站，可遵医嘱使用高锰酸钾坐浴促进愈合，出现发热或渗液增多需及时复诊。