肺曲霉菌病的临床表现主要有咳嗽、咯血、胸痛、发热等。症状按早期表现到终末期排列，可能伴随呼吸困难或全身衰竭。
1、咳嗽：
早期多为刺激性干咳，可能因曲霉菌侵袭支气管黏膜引起，随病情进展可转为脓痰或血痰。
2、咯血：
约半数患者出现痰中带血或大咯血，与真菌侵蚀血管有关，严重时可危及生命。
3、胸痛：
病变累及胸膜时出现针刺样疼痛，深呼吸时加重，可能提示存在曲霉菌球或胸膜炎。
4、发热：
常见于侵袭性肺曲霉菌病，体温可超过38.5℃，多伴有寒战、盗汗等全身中毒症状。
出现持续咳嗽伴咯血或不明原因发热时需及时就医，免疫功能低下者应避免接触霉变环境。
