巧克力囊肿多数情况下不严重，但可能引起痛经、不孕等症状。巧克力囊肿的严重程度主要与囊肿大小、症状表现、生育需求、是否恶变等因素有关。
直径小于4厘米的囊肿通常无明显症状，可通过定期复查监测；超过5厘米的囊肿可能压迫周围器官，需考虑手术治疗。
轻度痛经可通过热敷缓解，严重痛经可能需服用布洛芬、萘普生等止痛药；伴随不孕者需评估卵巢储备功能。
有生育需求者建议尽早干预，可选用促性腺激素释放激素激动剂抑制囊肿生长；无生育需求者可选择孕三烯酮等药物控制。
巧克力囊肿恶变概率较低，但绝经后新发囊肿或短期内快速增大需警惕，可通过肿瘤标志物检测和影像学检查排除。
建议患者每3-6个月复查超声，避免剧烈运动导致囊肿破裂，适量补充维生素E和深海鱼油有助于缓解炎症反应。
