先天性肛门畸形术后并发症主要包括切口感染、肛门狭窄、直肠黏膜脱垂、排便功能障碍等，需根据具体类型采取针对性治疗。
术后切口感染多与局部清洁不足或免疫力低下有关，表现为红肿渗液，需加强伤口消毒并遵医嘱使用头孢克洛、阿莫西林克拉维酸钾等抗生素。
瘢痕挛缩可能导致肛门狭窄，需定期扩肛治疗，严重者需行肛门成形术，可配合使用复方角菜酸酯栓缓解不适。
与盆底肌发育不良有关，轻症可通过提肛训练改善，严重脱垂需手术固定，可短期使用乳果糖预防便秘。
神经损伤或解剖异常可能导致便失禁或便秘，需进行生物反馈治疗，必要时使用蒙脱石散等药物调节排便。
术后需保持会阴清洁，定期随访评估肛门功能，饮食应富含膳食纤维但避免刺激性食物，遵医嘱进行肛门功能锻炼。
