不动纤毛综合征可能引发慢性鼻窦炎、支气管扩张、男性不育、中耳炎等并发症，严重者可出现肺心病。
纤毛功能障碍导致鼻腔分泌物滞留，可能引发反复鼻塞、脓涕等症状。可遵医嘱使用布地奈德鼻喷雾剂、桉柠蒎肠溶软胶囊、克拉霉素片等药物控制炎症。
呼吸道纤毛清除能力下降易诱发反复感染，表现为长期咳嗽、大量脓痰。需定期进行胸部物理治疗，急性期可使用头孢呋辛酯片、氨溴索口服液、乙酰半胱氨酸颗粒等药物。
精子尾部纤毛结构异常导致运动障碍，可能造成生育困难。建议通过辅助生殖技术解决生育问题，必要时可进行睾丸穿刺取精。
咽鼓管纤毛功能异常易引发中耳积液，表现为耳闷、听力下降。急性发作时可使用氧氟沙星滴耳液、阿莫西林克拉维酸钾片、糠酸莫米松鼻喷雾剂等药物。
患者需定期进行肺功能检查和影像学监测，保持适度运动增强呼吸道廓清能力，注意营养均衡以维持免疫力。
