阴茎短小通常无须药物治疗，若存在病理性原因可遵医嘱使用十一酸睾酮、绒促性素、生长激素或甲状腺激素等药物，建议先就医明确病因。
十一酸睾酮适用于睾酮缺乏导致的发育迟缓，需监测肝功能；绒促性素可促进睾丸分泌雄激素，禁用于前列腺癌患者。
生长激素对生长激素缺乏症有效，可能引起血糖升高；甲状腺激素适用于甲状腺功能减退患者，需定期检查甲状腺功能。
锌制剂对青春期发育有辅助作用；维生素D缺乏可能影响骨骼发育，补充前需检测血清浓度。
成人阴茎延长术适用于先天性畸形，需评估手术风险；假体植入术仅用于严重功能障碍患者。
日常保持均衡饮食与适度运动，避免盲目用药，所有治疗需在专科医生指导下进行。
